On sait que Naoko a travaillé pour le GEHIRN dans le développement du E-project avec Gendo et Yui. En 2004, Yui se fait absorbée par EVA-01 suite à une synchro à 400%. C'est Naoko qui supervise l'opération mais comme elle est secrètement amoureuse de Gendo, elle fera échouer la récupération. En 2010, elle met en service MAGI-System. Elle rencontre Rei-0000 (la première) qui a 9 ans. Rei lui dit d'un ton supérieur qu'elle n'a aucune chance d'être aimée par Gendo car c'est elle qui a été destinée à remplacer Yui. Naoko découvre alors la vérité à propos de Rei et de ses clones et décide de les détruire. Elle est retrouvée morte. Soi-disant "suicidée", elle a été sans doute assassinée par la SEELE. |
